Episódio 1 - The Prophet (O Profeta

A cada dia que passa Nicole fica mais triste com a ausência de Kyle e para tentar dar uma relaxada, ela e o marido decidem viajar. Aproveitando-se da situação, Josh dá uma festa para os amigos de escola. Com a ajuda de Adam Baylin, Kyle descobre tudo sobre sua criação, concepção,    vida e potencial. O garoto também descobre que apesar de possuir uma mente brilhante e poderosa ele tem um corpo fraco.

Episódio 2 - The Homecoming (A Volta Pra Casa)

Após o assassinato de Adam Baylin, Kyle não vê mais motivos para ficar afastado dos Tragers e com muito esforço ele convence Foss a deixá-lo morar, novamente, na casa que aprendeu chamar de lar. Pensando na segurança de Kyle, Foss explode o laboratório da Zzyzx onde o garoto foi criado, porém uma cobaia feminina consegue se salvar e fugir. Apesar de estar completamente pronta ela nunca teve contato com o mundo    externo, suas ações são imprevisíveis. Seus criadores acreditam que além de perigosa ela esteja completamente descontrolada e para encontrá-la contratam uma especialista.

Episódio 3 - The List of Life (A Lista da Vida)

Kyle descobre toda verdade sobre seu passado e, com a ajuda de Foss, além de desenvolver suas habilidades, ele também tem que se preocupar de como as usará para ajudar as pessoas. 
Mas apesar de toda tranquilidade aparente, Kyle não pode se descuidar, já que a Madacorp descobre que ele está vivo e pretende capturá-lo usando a cobaia XX.

Episódio 4 - Balancing Act (Balanço)

Determinado em explorar e desenvolver seu potencial, Kyle pretende fortalecer mente e corpo e assim ajudar as pessoas sem se prejudicar. 
Com a ajuda de Foss, ele cria uma nova rotina de vida, mas fazer tudo dar certo está sendo mais complicado do que Kyle imaginava. 
Enquanto Amanda nem quer falar com Kyle, Lori não consegue tirar Declan da cabeça. Stephen é pego de surpresa com a notícia que está desempregado, justo agora que havia prometido um carro novo para Josh.

Episódio 5 - Come To Your Senses (Apurando Os Sentidos)

Apesar de ter salvado Amanda de um invasor, Kyle e a amiga ainda não estão numa boa. Enquanto Stephen desconfia que Josh está fazendo uso de drogas ilícitas, Emely consegue introduzir Jessi, a Cobaia XX, na vida dos Tragers.

Episódio 6 - Does Kyle Dream Of Eletric Fish? (Kyle Sonha Com Peixe Elétrico)

Após ter uma visão reveladora, Kyle prevê que algo de muito ruim iria acontecer e, para surpresa de todos, em poucos segundos um terremoto abala a cidade. Stephen está muito feliz com o novo emprego e nem imagina que está trabalhando para o inimigo. Já Josh acha que o carro que ganhou o ajudará a ter uma vida social mais agitada, porém sua amiga Andy pensa justamente o contrário e resolve ajudá-lo.

Episódio 7 - Free to Be You and Me (Livre Para Sermos Você e Eu)

Após o inexplicável sumiço de Foss, Kyle passa dedicar mais tempo a sua vida pessoal e aceita o convite de ir ao baile da primavera com Amanda. Jessi e Kyle têm o primeiro contato, mas é com Declan que ela dá início a uma amizade colorida. Emily põe seu plano em prática e rapidamente se enturma com Stephen. 

Episódio 8 - What´s The Frequency, Kyle? (Kyle, Qual é a Frequência?)

O ataque a Lori causa reações bem diferentes aos homens da família Tragers; enquanto Kyle e Stephen só querem protegê-la, Josh quer descobrir e punir quem bateu em sua irmã. 
Kyle e Declan voltam ser grandes amigos e confidentes. William, pai de Stephen é internado em estado grave e, como os dois não se falam já há alguns anos, Kyle pensa numa maneira de reaproximá-los.

Episódio 9 - Ghost in the Machine (Fantasma na Máquina)

Sem dar explicações, Foss reaparece e jura inocência, porém Kyle não pretende lhe dar uma nova chance. Lori convence todos a irem com ela até a floresta, mais precisamente ao local aonde o caçador foi morto. 

Episódio 10 - House of Cards (Casa das Cartas)

Enquanto Josh só pensa em ajudar Andy, Julian está bem contente com os resultados de seu plano de desestabilizar a família Trager. Jessi está muito próxima de descobrir o segredo de Emily e consequentemente toda a verdade sobre seu passado. Quando descobre que Julian usa um anel igual ao de Adam, Kyle, com a ajuda de Declan e Foss, traça um plano para invadir a Madacorp e pôr as mãos na peça.

Episódio 11 - Hands On A Hybrid (Mãos Sobre O Carro)

Os Tragers vão participar de um evento beneficente. Apesar de estarem indo por lados bem diferentes, tanto Kyle como Nicole estão bem perto de descobrirem toda a verdade sobre Jessi. Enquanto Josh quer ganhar o carro para ajudar Andy, Kyle vê uma grande oportunidade de se aproximar de Jessi. Refém da Madacorp, Foss é usado como cobaia justamente na máquina que Stephen ajudou a desenvolver.

Episódio 12 - Lockdown (Trancados)

Após o incidente com Kyle, Jessi descobre toda verdade e foge. Ao saber que Jessi a atacou, Lori passa o tempo todo pensando em como se vingar.  Com Jessi à solta, Nicole confina toda família e a casa dos Tragers vira em verdadeiro campo de guerra com todos brigando. Kyle se sente culpado pela crise familiar e passa a sentir fortes dores de cabeças com vertigens. Durante um desses surtos, ele vai para uma realidade paralela onde se encontra com Adam, que o ajuda a entender tudo o que está acontecendo. 

Episódio 13 - Leap Of Faith (Ato de Fé)

Kyle encontra Jessi e, mesmo sabendo de todo perigo que está correndo, ele está disposto a arriscar tudo para ajudá-la. Embora magoados, Nicole e Stephen estão trabalhando juntos para descobrir toda verdade sobre Kyle, Jessi e Madacorp. Enquanto Foss consegue fugir da sede da Madacorp, Lori e Declan brigam depois que ela descobre que ele ajudou Kyle a fugir de casa para procurar a Jessi.